Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf6Q91YR7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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