Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms