Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Slc6a20aQ8VDB9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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