Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms