Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr3Q8K296 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtmr3Q8K296 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms