Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire2Q8K1S6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms