Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms