Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms