Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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