Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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