Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc63Q8CDV6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms