Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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