Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8C708 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms