Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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