Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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