Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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