Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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