Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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