Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms