Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms