Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan9Q8BJU2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan9Q8BJU2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms