Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms