Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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