Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpp38Q80UU2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms