Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms