Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms