Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vma21Q78T54 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vma21Q78T54 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vma21Q78T54 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vma21Q78T54 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vma21Q78T54 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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