Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms