Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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