Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms