Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms