Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms