Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms