Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms