Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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