Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms