Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms