Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim27Q62158 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim27Q62158 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim27Q62158 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim27Q62158 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim27Q62158 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Trim27Q62158 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim27Q62158 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim27Q62158 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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