Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sin3bQ62141 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms