Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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