Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms