Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms