Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms