Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Csnk2a1Q60737 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms