Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LpoQ5SW46 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms