Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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