Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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