Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim41Q5NCC3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms