Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms