Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f8Q58FA4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms